56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1755 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
347 aa  716    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  61.34 
 
 
350 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  61.05 
 
 
348 aa  448  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  59.88 
 
 
348 aa  440  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  59 
 
 
348 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  59 
 
 
348 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  58.43 
 
 
351 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  48.82 
 
 
339 aa  320  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  33 
 
 
745 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  32.79 
 
 
362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  30.19 
 
 
367 aa  140  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  32.59 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  32.7 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  32.59 
 
 
367 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  31.94 
 
 
362 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  29 
 
 
373 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  32.7 
 
 
367 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  32.7 
 
 
367 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  32.01 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  31.82 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  31.37 
 
 
362 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  31.07 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  31.35 
 
 
369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  28.08 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  31.52 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  30.16 
 
 
612 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  31.29 
 
 
366 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  32.59 
 
 
369 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  29.17 
 
 
745 aa  123  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  28.82 
 
 
367 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  28.94 
 
 
356 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  29.45 
 
 
367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  31.25 
 
 
323 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0484  polysaccharide pyruvyl transferase  28.14 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  29.21 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  25.08 
 
 
1225 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1683  polysaccharide pyruvyl transferase  25.21 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.167545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  29.28 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  28.05 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  22.19 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  26.47 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  25.34 
 
 
341 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1309  polysaccharide pyruvyl transferase  24.92 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  22.62 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  27.37 
 
 
382 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  27.37 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  23.81 
 
 
383 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0990  polysaccharide pyruvyl transferase  32.46 
 
 
336 aa  62.8  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  22.92 
 
 
378 aa  59.3  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3253  putative polysaccharide pyruvyl transferase  24.54 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151053  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0247  polysaccharide pyruvyl transferase  25.27 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0249  polysaccharide pyruvyl transferase  24.91 
 
 
316 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  24.26 
 
 
374 aa  57  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  23.42 
 
 
359 aa  56.2  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  25.65 
 
 
395 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1801  hypothetical protein  21.45 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>