52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2979 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  99.06 
 
 
426 aa  879    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  97.89 
 
 
426 aa  872    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  100 
 
 
426 aa  884    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  97.89 
 
 
426 aa  870    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  98.83 
 
 
426 aa  877    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  98.59 
 
 
426 aa  875    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  98.83 
 
 
426 aa  877    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  87.56 
 
 
426 aa  785    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  97.89 
 
 
426 aa  872    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  66.67 
 
 
426 aa  617  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  67.45 
 
 
426 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  67.45 
 
 
426 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  66.9 
 
 
426 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  66.43 
 
 
426 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  27.07 
 
 
428 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  24.66 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  21.3 
 
 
405 aa  67  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  21.2 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  21.05 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  22.84 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  23.62 
 
 
1225 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  20.56 
 
 
366 aa  63.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  21.12 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  19.76 
 
 
370 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  19.33 
 
 
745 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  20 
 
 
438 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  21.07 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  20.79 
 
 
367 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  21.58 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  20.79 
 
 
367 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  20.79 
 
 
367 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  20.79 
 
 
367 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  19.84 
 
 
375 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  22.43 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  19.33 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  22.11 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  20.53 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  22.41 
 
 
367 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  20.13 
 
 
400 aa  50.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  22.95 
 
 
612 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  22.34 
 
 
431 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  21.43 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  22.41 
 
 
432 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  20.64 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  17.6 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  18.58 
 
 
745 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  19.43 
 
 
431 aa  46.6  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  24.51 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  21.25 
 
 
373 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  19.77 
 
 
362 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0824  hypothetical protein  21.68 
 
 
422 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00269709  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  23.19 
 
 
395 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>