60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3792 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  745    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3253  putative polysaccharide pyruvyl transferase  46.09 
 
 		 381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1801  hypothetical protein  33.43 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  24.32 
 
 		 395 aa  86.3  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  26.05 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  26.05 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  23.77 
 
 		 745 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  22.9 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  22.15 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  23.36 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  23.99 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  23.68 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  23.68 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  22.74 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  20.9 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  22.47 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  21.51 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  23.72 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  21.14 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  21.71 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  21.71 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  21.14 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  23.42 
 
 		 347 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  20.87 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  20.37 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  25.16 
 
 		 367 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  21.47 
 
 		 348 aa  52.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  25.84 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  22.69 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  22.46 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  24.22 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  20.18 
 
 		 745 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  24.93 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  22.16 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  35 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  35 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  35 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  35 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  35 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  29.47 
 
 		 435 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  24.9 
 
 		 426 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  20.81 
 
 		 366 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  21.97 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  38.98 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0147  hypothetical protein  23.49 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  24.51 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  23.68 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  24.51 
 
 		 426 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  25.54 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  23.23 
 
 		 426 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1193  putative polysaccharide pyruvyl transferase  34.48 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  19.72 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  35 
 
 		 426 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  24.51 
 
 		 426 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  24.51 
 
 		 426 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  35 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  35 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  22.19 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  22.12 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  22.32 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>