26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1801 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1801  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  757    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  34.54 
 
 		 359 aa  245  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3253  putative polysaccharide pyruvyl transferase  33.78 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151053  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  23.28 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  24.16 
 
 		 612 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  23.65 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  23.08 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  23.21 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  22.46 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.68 
 
 		 745 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  23.17 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  23.56 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  21.2 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  22.19 
 
 		 367 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  21.24 
 
 		 745 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  22.05 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  22.05 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  21.43 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  22.09 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  23.84 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  21.43 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  21.45 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  26.1 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  24.63 
 
 		 438 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  19.63 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0147  hypothetical protein  24.54 
 
 		 355 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>