79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0123 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
356 aa  717    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  42.11 
 
 
366 aa  279  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  39.78 
 
 
377 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  42.18 
 
 
367 aa  262  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  41.94 
 
 
388 aa  259  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  38.25 
 
 
373 aa  249  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  37.5 
 
 
367 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  40.73 
 
 
369 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  37.74 
 
 
367 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  37.74 
 
 
367 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  37.74 
 
 
367 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  37.19 
 
 
367 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  37.74 
 
 
367 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  36.03 
 
 
745 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  35.11 
 
 
375 aa  226  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  37.87 
 
 
362 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  37.54 
 
 
362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  37.74 
 
 
369 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  37.87 
 
 
362 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  36.59 
 
 
370 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  36.62 
 
 
400 aa  209  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  33.78 
 
 
612 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  34.27 
 
 
745 aa  196  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  32.48 
 
 
348 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  33.66 
 
 
339 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  30.33 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  34.4 
 
 
383 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  34.6 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  35.29 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  33.66 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  30.16 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  31.06 
 
 
348 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  29.84 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  26.61 
 
 
438 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  31.82 
 
 
382 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  29.74 
 
 
348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  29.74 
 
 
348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  26.67 
 
 
1225 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  28.81 
 
 
341 aa  116  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  28.94 
 
 
347 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  30.99 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  27.73 
 
 
360 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0484  polysaccharide pyruvyl transferase  30.49 
 
 
336 aa  99.8  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  29.96 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  27.68 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  30.84 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  29.61 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  27.04 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0247  polysaccharide pyruvyl transferase  27.05 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0249  polysaccharide pyruvyl transferase  27.15 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1309  polysaccharide pyruvyl transferase  24.42 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  23.91 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  24.5 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0990  polysaccharide pyruvyl transferase  22.93 
 
 
336 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  25.22 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  23.7 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1056  hypothetical protein  23.17 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2576  polysaccharide pyruvyl transferase  26.74 
 
 
406 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  22.13 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  21.21 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  27.83 
 
 
430 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1193  putative polysaccharide pyruvyl transferase  26.85 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  23.31 
 
 
428 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  22.28 
 
 
431 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1683  polysaccharide pyruvyl transferase  29.34 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.167545  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  23.34 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2981  hypothetical protein  23.68 
 
 
387 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  27.09 
 
 
392 aa  53.1  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  19.62 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  22.69 
 
 
359 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4907  polysaccharide pyruvyl transferase  23.03 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  23.22 
 
 
394 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0147  hypothetical protein  22.15 
 
 
355 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  21.45 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  21.87 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3539  polysaccharide pyruvyl transferase  26.67 
 
 
428 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  25.47 
 
 
432 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0030  hypothetical protein  25.86 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  20.73 
 
 
418 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>