90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3117 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
370 aa  768    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  36.59 
 
 
356 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  36.51 
 
 
373 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  41.03 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  36.27 
 
 
612 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  34.25 
 
 
745 aa  202  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  35.62 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  36.34 
 
 
367 aa  196  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  35.77 
 
 
366 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  33.87 
 
 
745 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  34.72 
 
 
388 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  36.59 
 
 
377 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  33.71 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  34.75 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  36.45 
 
 
362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  32.52 
 
 
369 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  32.49 
 
 
367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  32.49 
 
 
367 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  32.49 
 
 
367 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  32.2 
 
 
367 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  32.2 
 
 
367 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  33.71 
 
 
362 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  29.5 
 
 
395 aa  159  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  34.95 
 
 
369 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  28.45 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  31.65 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  25.43 
 
 
408 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  24.94 
 
 
438 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  29.03 
 
 
374 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  32.17 
 
 
378 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  30.6 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  31.25 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  28.27 
 
 
1225 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  30.57 
 
 
339 aa  113  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  29.7 
 
 
382 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  29.52 
 
 
348 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  29.52 
 
 
348 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  29.28 
 
 
347 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  27.85 
 
 
360 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  29.17 
 
 
348 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  27.53 
 
 
350 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  23.46 
 
 
413 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  28.8 
 
 
323 aa  92.8  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1056  hypothetical protein  24.61 
 
 
408 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  23.21 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  29.97 
 
 
332 aa  90.1  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  26.02 
 
 
428 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  30.25 
 
 
332 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  27.16 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0484  polysaccharide pyruvyl transferase  27.12 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  21.28 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  24.47 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  27.14 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  22.05 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  22.61 
 
 
413 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  20.7 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  20.7 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0147  hypothetical protein  25.39 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  20.47 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  20.47 
 
 
426 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  20.47 
 
 
426 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  20.47 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  20 
 
 
426 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  20.05 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  22.88 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  20.23 
 
 
426 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  23.4 
 
 
431 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1309  polysaccharide pyruvyl transferase  32.35 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1193  putative polysaccharide pyruvyl transferase  25.08 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  21.83 
 
 
426 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  25.12 
 
 
395 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  21.85 
 
 
431 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1683  polysaccharide pyruvyl transferase  25.41 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.167545  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  19.43 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0990  polysaccharide pyruvyl transferase  25.75 
 
 
336 aa  57  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1726  hypothetical protein  22.3 
 
 
437 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.045903 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  21.4 
 
 
430 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  20.16 
 
 
426 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  19.64 
 
 
426 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  19.9 
 
 
426 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  19.9 
 
 
426 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  19.64 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1801  hypothetical protein  22.77 
 
 
368 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0247  polysaccharide pyruvyl transferase  30.07 
 
 
316 aa  53.1  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0249  polysaccharide pyruvyl transferase  30.07 
 
 
316 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0030  hypothetical protein  20.91 
 
 
347 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4907  polysaccharide pyruvyl transferase  22.16 
 
 
332 aa  50.4  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1238  hypothetical protein  21.09 
 
 
509 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235902  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5114  hypothetical protein  22.02 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719605 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  20.27 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.920771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>