60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0200 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 323 aa  629  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  48.45 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  47.83 
 
 		 332 aa  251  8.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  34.6 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  31.13 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  39.13 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  31.89 
 
 		 367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  31.89 
 
 		 367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  31.89 
 
 		 369 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  31.89 
 
 		 367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  32.23 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  31.44 
 
 		 745 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  30.82 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  31.89 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  35.39 
 
 		 367 aa  149  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  29.75 
 
 		 612 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  30.13 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  36.01 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  30.46 
 
 		 362 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  30.13 
 
 		 745 aa  139  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  33.04 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  29.91 
 
 		 373 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  31.25 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  33.22 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  32.12 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  32.88 
 
 		 366 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  33.01 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  32.67 
 
 		 348 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  32.67 
 
 		 348 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  32.14 
 
 		 367 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  32.31 
 
 		 350 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0484  polysaccharide pyruvyl transferase  36.48 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1309  polysaccharide pyruvyl transferase  30.69 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  28.8 
 
 		 370 aa  99.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  32.03 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  33.02 
 
 		 360 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0247  polysaccharide pyruvyl transferase  28.63 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0249  polysaccharide pyruvyl transferase  29.01 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  24.92 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  27.63 
 
 		 400 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0990  polysaccharide pyruvyl transferase  26.28 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  25 
 
 		 1225 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1683  polysaccharide pyruvyl transferase  22.81 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.167545  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  31.68 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  24.73 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  28.24 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  29.81 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  28.12 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  25.3 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  20.18 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0147  hypothetical protein  23.55 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  27.95 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4907  polysaccharide pyruvyl transferase  20.76 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  24.93 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  25.22 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  28.17 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1193  putative polysaccharide pyruvyl transferase  27.55 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  26.18 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3253  putative polysaccharide pyruvyl transferase  24.11 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2576  polysaccharide pyruvyl transferase  34.78 
 
 		 406 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>