49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0140 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  80.84 
 
 		 431 aa  719    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  888    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  32.23 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  28.78 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.52 
 
 		 745 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0829  polysaccharide pyruvyl transferase  25.87 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270983  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  23.94 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  31.48 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  24.5 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  30.4 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  30.56 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  25.26 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  28.83 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  23.74 
 
 		 388 aa  67  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  26.34 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  22.66 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  27.14 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  23.71 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  26.67 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  23.71 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  26.32 
 
 		 745 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  25.77 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  27.83 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  21.57 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  19.85 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  24.88 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  25.94 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2981  hypothetical protein  25.76 
 
 		 387 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  21.4 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0824  hypothetical protein  23.86 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00269709  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  22.71 
 
 		 341 aa  54.7  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  20.98 
 
 		 395 aa  53.1  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  25.36 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  23.86 
 
 		 612 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  22.87 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  19.91 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  21.59 
 
 		 367 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  22.4 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  27.98 
 
 		 1225 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  17.87 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  17.23 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  17.6 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  18.82 
 
 		 426 aa  46.6  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  17.23 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  17.23 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  17.53 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  16.85 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  16.85 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  22.75 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>