58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1425 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  701    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  62.75 
 
 
351 aa  391  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  55.81 
 
 
367 aa  342  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  32.85 
 
 
339 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  30.59 
 
 
350 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  29.14 
 
 
348 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  28.08 
 
 
347 aa  135  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  29.91 
 
 
375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  30.75 
 
 
348 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  29.84 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  30.13 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  29.09 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  28.81 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  29.09 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  29.26 
 
 
369 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  30.12 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  30.12 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  28.39 
 
 
362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  28.43 
 
 
362 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  32.29 
 
 
367 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  26.75 
 
 
612 aa  123  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  22.68 
 
 
745 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  27.53 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  32.77 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  33.87 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  29.09 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  26.84 
 
 
373 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  27.88 
 
 
356 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  32.3 
 
 
351 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  27.22 
 
 
367 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  28.69 
 
 
377 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  29.77 
 
 
341 aa  95.9  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  22.98 
 
 
745 aa  92.8  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  31.83 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  28.08 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  27.94 
 
 
1225 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  32.3 
 
 
332 aa  86.3  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0484  polysaccharide pyruvyl transferase  33.11 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  26.05 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1309  polysaccharide pyruvyl transferase  30.56 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  26.76 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  32.06 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1683  polysaccharide pyruvyl transferase  24.71 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.167545  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0249  polysaccharide pyruvyl transferase  32.64 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0247  polysaccharide pyruvyl transferase  31.65 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  24.94 
 
 
383 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  26.5 
 
 
378 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  23.89 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0990  polysaccharide pyruvyl transferase  33.33 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  25.91 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  23.93 
 
 
382 aa  53.1  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  22.7 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  22.92 
 
 
408 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  24.49 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0147  hypothetical protein  26.52 
 
 
355 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  20.69 
 
 
438 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  24.26 
 
 
374 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  24.22 
 
 
367 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>