45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0249 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0249  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
316 aa  645    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0247  polysaccharide pyruvyl transferase  98.42 
 
 
316 aa  639    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1309  polysaccharide pyruvyl transferase  37.07 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0990  polysaccharide pyruvyl transferase  31.97 
 
 
336 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1683  polysaccharide pyruvyl transferase  24.71 
 
 
341 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.167545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  30.99 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  26 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  25.09 
 
 
369 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  33.56 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  32.21 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  32.21 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  32.21 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  32.21 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  32.21 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  33.11 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  24.82 
 
 
362 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  31.54 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  31.54 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  32.08 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  32.08 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  31.94 
 
 
745 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  30.73 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  33.33 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  25.69 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0484  polysaccharide pyruvyl transferase  35.4 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  29.01 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  25.4 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  29.45 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  31.86 
 
 
745 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  35.33 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  32.21 
 
 
369 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  31.94 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  32.28 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  32.56 
 
 
400 aa  62.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  32.69 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  32.35 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  24.91 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  25.16 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  29.03 
 
 
612 aa  56.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  30.3 
 
 
367 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  32.73 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  27.22 
 
 
341 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  27.93 
 
 
351 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  25.56 
 
 
1225 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  27.05 
 
 
428 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>