57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0618 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  845    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  45.27 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  22.56 
 
 		 745 aa  87  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  25.91 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  22.48 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  23.53 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  23.2 
 
 		 745 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  23.53 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  23.53 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  23.53 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  23.94 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  22.22 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  21.2 
 
 		 366 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  21.48 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  21.46 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  21.03 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  21.33 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  20.73 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  21.22 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  21.22 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  20.63 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  24.19 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  22.89 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  19.65 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  22.22 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  21.74 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  22.96 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  21.74 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  22.44 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  22.99 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  21.3 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  21.89 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  21.3 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  21.3 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  21.3 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  21.3 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  23.42 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  21.21 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  21.45 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  23.48 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  19.02 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  19.95 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  25 
 
 		 374 aa  57  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  22.06 
 
 		 612 aa  56.6  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  21.15 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  22.07 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  19.79 
 
 		 378 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  19.91 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2576  polysaccharide pyruvyl transferase  21.86 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4907  polysaccharide pyruvyl transferase  34.67 
 
 		 332 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  44.44 
 
 		 332 aa  46.6  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  28.72 
 
 		 392 aa  46.6  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3277  hypothetical protein  42.86 
 
 		 286 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  23.84 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  23.84 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3251  hypothetical protein  25.26 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  39.53 
 
 		 332 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>