More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0838 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
419 aa  850    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  29.74 
 
 
395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
394 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
374 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
398 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
377 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
379 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
360 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
377 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 
380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.98 
 
 
373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
381 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
413 aa  146  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 
403 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
364 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.25 
 
 
366 aa  140  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
379 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
370 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  33 
 
 
365 aa  137  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
376 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
393 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
364 aa  136  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
389 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.44 
 
 
359 aa  130  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
440 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.02 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
364 aa  127  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
374 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
385 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.4 
 
 
745 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.14 
 
 
389 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
395 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
374 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
383 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
370 aa  123  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.16 
 
 
381 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
394 aa  119  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
387 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
390 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  24.76 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
371 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  36.4 
 
 
468 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
374 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
376 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
394 aa  114  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  33.14 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 
355 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
387 aa  113  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  26.07 
 
 
350 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
390 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
379 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
411 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
410 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
391 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  27.3 
 
 
365 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
378 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00458  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.52 
 
 
363 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  22.63 
 
 
366 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
383 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
377 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
384 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  34.12 
 
 
360 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
371 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
392 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  22.63 
 
 
366 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>