More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2460 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 381 aa  779    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  53.74 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  49.32 
 
 		 383 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 		 371 aa  206  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.2 
 
 		 359 aa  199  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 399 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 380 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 371 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.77 
 
 		 411 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 377 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.79 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 		 398 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 412 aa  142  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  29.69 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.2 
 
 		 365 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 371 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 439 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.18 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 392 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 369 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  33.75 
 
 		 376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 		 382 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 		 376 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  33.89 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.38 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 379 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  27.69 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  26.54 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  26.54 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  26.54 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  37.61 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 374 aa  116  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  28.22 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.62 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.59 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.62 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  26.85 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  27.8 
 
 		 745 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 389 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  26.42 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>