More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01302 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
359 aa  743    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  53.8 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  35.38 
 
 
385 aa  225  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
383 aa  205  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
381 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.75 
 
 
365 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
377 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
394 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
379 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.51 
 
 
367 aa  133  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
393 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.71 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.44 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
389 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  28.87 
 
 
372 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 
399 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
374 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
403 aa  126  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
395 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
382 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
390 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
390 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  27.06 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
376 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
412 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
372 aa  119  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
390 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
379 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
373 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
384 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.38 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
412 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
392 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.85 
 
 
381 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.14 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.45 
 
 
745 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.39 
 
 
381 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.49 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  23.78 
 
 
388 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  28.43 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  28.43 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  28.43 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
750 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 
381 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
387 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.47 
 
 
366 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  27.45 
 
 
362 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.91 
 
 
349 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 
381 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
369 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
381 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  26.47 
 
 
366 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  26.47 
 
 
366 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
388 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.47 
 
 
366 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  26.47 
 
 
366 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.86 
 
 
369 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  26.81 
 
 
745 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
389 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
370 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
364 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
360 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
385 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 
363 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
381 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 
439 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
361 aa  102  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  22.34 
 
 
382 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
395 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 
374 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
355 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 
391 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
374 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
368 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
377 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
371 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
395 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
398 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 
369 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  21.88 
 
 
395 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>