More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0283 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 360 aa  737    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  51.29 
 
 		 360 aa  371  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  52.51 
 
 		 363 aa  371  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  51.68 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  50.14 
 
 		 361 aa  346  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  48.71 
 
 		 364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  48.86 
 
 		 359 aa  325  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  44.7 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  28.61 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.97 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.69 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  26.69 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.97 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3299  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  30.83 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  28.67 
 
 		 745 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  30.42 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  30.42 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 377 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 390 aa  99.8  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 		 367 aa  99.4  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 		 399 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 386 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 380 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  28.81 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 		 371 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.76 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 388 aa  92.8  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 		 419 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  28.11 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  28.9 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3017  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 397 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 385 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 409 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 364 aa  90.1  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 395 aa  90.1  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  31.25 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 		 368 aa  90.1  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 		 398 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.99 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 392 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 739 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 		 376 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  26.23 
 
 		 411 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.12 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 365 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  31.6 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 425 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.6 
 
 		 427 aa  87  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>