More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2380 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
391 aa  780    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  74.15 
 
 
390 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  46.95 
 
 
436 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
381 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
398 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
391 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
536 aa  129  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  40.47 
 
 
370 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
390 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
372 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
385 aa  126  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  35.74 
 
 
382 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
360 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 
389 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
439 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
393 aa  122  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
410 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 
372 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 
387 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
371 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  39.04 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
414 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
389 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
372 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
374 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.04 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
415 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.04 
 
 
385 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
396 aa  117  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
394 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  31.47 
 
 
371 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
391 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  35.27 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
424 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
373 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  35.71 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  37.82 
 
 
388 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
386 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 
401 aa  113  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
373 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  38.91 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.89 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.27 
 
 
373 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.08 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
362 aa  109  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
370 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
384 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.73 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
424 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 
403 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
387 aa  109  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  42.19 
 
 
408 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
392 aa  109  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  33.78 
 
 
382 aa  109  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 
364 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
380 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
415 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
377 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
419 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
409 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
395 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
386 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
380 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
385 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
426 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
414 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 
375 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
399 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
381 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  32.49 
 
 
346 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  40.45 
 
 
372 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
385 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22.43 
 
 
396 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
378 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 
368 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
385 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 
379 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0980  glycosyl transferase group 1  37.02 
 
 
378 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.24 
 
 
365 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
392 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>