More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3176 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 373 aa  763    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  34.49 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0231  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 		 378 aa  205  9e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  31.64 
 
 		 387 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 392 aa  146  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 383 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1323  glycosyltransferase  29.47 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.59185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 384 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 356 aa  109  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2648  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 236 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.36 
 
 		 365 aa  99.8  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 398 aa  99.4  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 401 aa  99.4  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  32.24 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 345 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  26.63 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.63 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 		 384 aa  93.6  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 378 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.39 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 		 372 aa  89.4  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  29.68 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.66 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  22.85 
 
 		 371 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  25.92 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 		 377 aa  86.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.16 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  25.72 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1742  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.711443  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0231  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  27.03 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  27.11 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.72 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  25.72 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.3 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.63 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.99 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  25.46 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.46 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.36 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  27.86 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  33.14 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 930 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  26.54 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1656  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.54 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  27.88 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.1 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>