More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0231 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0231  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
366 aa  743    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1656  glycosyl transferase, group 1 family protein  59.89 
 
 
366 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1742  glycosyl transferase group 1  53.95 
 
 
371 aa  401  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.711443  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0573  glycosyl transferase group 1  57.87 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.040919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1285  glycosyl transferase, group 1  54.37 
 
 
389 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.104889  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.42 
 
 
365 aa  96.3  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
403 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
368 aa  90.1  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
389 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
386 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.34 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1099  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  33.84 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
394 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.58 
 
 
411 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1904  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1970  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.2 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2857  group 1 glycosyl transferase  26.27 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  28.94 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4006  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.7 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2695  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
371 aa  72.8  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  27.01 
 
 
413 aa  72.8  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  28.92 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.22 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
409 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  25.51 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  23.92 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
750 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.92 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  23.92 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  23.92 
 
 
366 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.92 
 
 
366 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  26.71 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
422 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
408 aa  67  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.52 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
439 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.32 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 
405 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>