More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1523 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  100 
 
 
387 aa  801    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  42.26 
 
 
385 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  40.48 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  37.66 
 
 
391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  38.52 
 
 
382 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0231  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
378 aa  205  9e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.282789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
383 aa  202  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
378 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.64 
 
 
373 aa  192  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
371 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
392 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1323  glycosyltransferase  29.13 
 
 
370 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.59185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
384 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2648  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
236 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
393 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  30.26 
 
 
822 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 
361 aa  116  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
403 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
387 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
377 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
370 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
389 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
387 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
395 aa  106  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
372 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
387 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
373 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  24.1 
 
 
379 aa  102  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
384 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
388 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  26.2 
 
 
393 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
369 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
377 aa  96.3  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
439 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
412 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0373  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
398 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
385 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0759  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
394 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
385 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
378 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
345 aa  92.8  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.14 
 
 
367 aa  92.8  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.09 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
821 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.06 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.67 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
387 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
362 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
371 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
371 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  28.14 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  24.29 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 
371 aa  90.1  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
399 aa  89.7  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
818 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
381 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.11 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
440 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.23 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
819 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
386 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  25.97 
 
 
820 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  25.53 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.32 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  24.07 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
504 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
821 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
368 aa  84  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>