More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1562 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 381 aa  711    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  48.28 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 		 377 aa  142  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  36.15 
 
 		 370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 		 379 aa  135  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  38.41 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 		 387 aa  129  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 353 aa  126  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.8 
 
 		 407 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  27.11 
 
 		 745 aa  125  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 		 374 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  33.24 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 394 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  37.07 
 
 		 353 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.77 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  21.98 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  34.7 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 		 380 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  36.33 
 
 		 371 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  28.24 
 
 		 353 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 		 393 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  42.27 
 
 		 739 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  48.07 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  42.76 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  35.28 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 536 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.36 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 342 aa  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 		 446 aa  113  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 		 404 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 377 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 		 750 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.74 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  35.01 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  22.04 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  35.01 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.98 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  33.04 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  27.54 
 
 		 745 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  35.13 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  26.4 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  34.7 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 		 357 aa  110  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 391 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 		 425 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 369 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 		 379 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.47 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 		 414 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  42.33 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  27.45 
 
 		 374 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>