More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2519 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  100 
 
 
384 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  50.43 
 
 
369 aa  346  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  48.71 
 
 
353 aa  345  8.999999999999999e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  48.31 
 
 
374 aa  333  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1139  glycosyl transferase, group 1  48.56 
 
 
366 aa  312  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0404734  normal  0.023827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  45.3 
 
 
353 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  43.06 
 
 
383 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  39.32 
 
 
351 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
377 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  37.64 
 
 
370 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.11 
 
 
373 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
382 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
371 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
360 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
356 aa  107  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  40.82 
 
 
348 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.65 
 
 
365 aa  106  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
393 aa  106  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  37.55 
 
 
412 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
384 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
380 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
387 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
419 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
378 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 
421 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  28.23 
 
 
379 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
386 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.52 
 
 
366 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  30.2 
 
 
371 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  34.24 
 
 
340 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.31 
 
 
360 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  35.68 
 
 
369 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
372 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
378 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
385 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 
417 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.14 
 
 
415 aa  99.8  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  35.93 
 
 
390 aa  99.4  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
355 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 
373 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  39.63 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
364 aa  97.1  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
383 aa  96.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  39.47 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.35 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
425 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
417 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
381 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
381 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
380 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 
420 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
360 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
383 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 
351 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
394 aa  93.6  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
371 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
335 aa  93.6  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
366 aa  93.2  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
355 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 
379 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.65 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
419 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  36.56 
 
 
370 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
399 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  36.81 
 
 
1032 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.37 
 
 
745 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.62 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 
395 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
374 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
424 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
373 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
384 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>