More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4553 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
353 aa  711    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  47.28 
 
 
353 aa  328  9e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  46.97 
 
 
369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1139  glycosyl transferase, group 1  47.99 
 
 
366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0404734  normal  0.023827 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  44.6 
 
 
374 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  43.87 
 
 
383 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  42.65 
 
 
351 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  45.3 
 
 
384 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 
386 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
384 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
387 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
390 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
381 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
398 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
366 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
376 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
382 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.08 
 
 
401 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.27 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  29.8 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
374 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
377 aa  93.6  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.77 
 
 
745 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
360 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
371 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  23.73 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
371 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
364 aa  90.1  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
372 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
536 aa  89.7  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.78 
 
 
745 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.99 
 
 
373 aa  89.7  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  33.46 
 
 
365 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
409 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.09 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.15 
 
 
385 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
378 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
395 aa  87  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
377 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.86 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
378 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
389 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
1080 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.48 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
379 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
360 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
871 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.97 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.86 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
816 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>