More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0291 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
360 aa  733    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  57.6 
 
 
363 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  53.6 
 
 
364 aa  384  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  51.29 
 
 
360 aa  371  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  54.18 
 
 
359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  45.85 
 
 
350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  45.27 
 
 
361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  44.96 
 
 
357 aa  298  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
364 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
364 aa  123  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
355 aa  119  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
386 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3017  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
360 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 
399 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.1 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
393 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
390 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 
380 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
379 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
379 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
368 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
387 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
380 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
386 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
379 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  31.86 
 
 
374 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  31.45 
 
 
379 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
375 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 
399 aa  102  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
380 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
398 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
389 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
360 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
361 aa  99.8  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
383 aa  99.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
374 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 
417 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3299  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
362 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
387 aa  97.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  24.74 
 
 
346 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
371 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
739 aa  96.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
383 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
417 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
380 aa  95.9  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.67 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 
420 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.86 
 
 
745 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  29.65 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
409 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
390 aa  93.6  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  32.07 
 
 
366 aa  93.2  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
366 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.35 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 
419 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
363 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  31.47 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  33.33 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  37.59 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
419 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
395 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
364 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
374 aa  90.1  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  30 
 
 
365 aa  90.5  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
403 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
407 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.42 
 
 
349 aa  90.1  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
384 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  30 
 
 
365 aa  89.7  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
396 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
370 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.18 
 
 
370 aa  89.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.8 
 
 
371 aa  89.7  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  30 
 
 
365 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
382 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.22 
 
 
366 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.98 
 
 
415 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
374 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>