More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0388 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 350 aa  721    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  45.85 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  45.04 
 
 		 364 aa  302  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  44.99 
 
 		 363 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  44.7 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  44.7 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  45.85 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  44.03 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 364 aa  132  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 364 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.78 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 		 368 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  30.34 
 
 		 745 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 363 aa  89.4  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  26.27 
 
 		 340 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3017  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 348 aa  85.9  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  27.01 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  27.56 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.78 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  28.02 
 
 		 745 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  22.98 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.66 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 		 739 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  30.84 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3299  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  27.91 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.97 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  22.75 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 750 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  27.9 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  30.4 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  29.06 
 
 		 371 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  25.89 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.96 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  28.05 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  27.55 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  25.1 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  21.8 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  26.45 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  29.55 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  28.42 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>