More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1472 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  100 
 
 
363 aa  749    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  57.6 
 
 
360 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  51.74 
 
 
364 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  52.5 
 
 
359 aa  376  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  52.51 
 
 
360 aa  371  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  49.01 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  45.17 
 
 
361 aa  320  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  44.99 
 
 
350 aa  301  9e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
364 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
364 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
364 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
355 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
387 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.92 
 
 
396 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
371 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
380 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
353 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
363 aa  99.8  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
380 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3093  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
361 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 
403 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
366 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
381 aa  96.3  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.62 
 
 
745 aa  96.3  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
348 aa  93.6  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
379 aa  93.2  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
379 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  31.4 
 
 
365 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.96 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  30.92 
 
 
365 aa  90.1  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
368 aa  89.7  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  30.92 
 
 
365 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 
385 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  28.17 
 
 
419 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
366 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  30.5 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
377 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
420 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.29 
 
 
346 aa  87.4  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  22.64 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
383 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
380 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3299  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.01 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  25.41 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
419 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
346 aa  84  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  27.34 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
417 aa  82.8  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
412 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  26.98 
 
 
468 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  21.26 
 
 
360 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.16 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
392 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.74 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3017  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  21.38 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  22.13 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
418 aa  79.3  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
356 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  29.85 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>