More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0798 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
396 aa  807    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  81.84 
 
 
426 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
369 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
371 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0391  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
392 aa  123  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
380 aa  120  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
410 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  38.05 
 
 
421 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3316  glycosyltransferase-like protein  29.55 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
379 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
412 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
412 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
399 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 
404 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
415 aa  106  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
412 aa  106  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.02 
 
 
378 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.08 
 
 
409 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  34.53 
 
 
353 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
386 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
356 aa  104  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
406 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.01 
 
 
388 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
419 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
376 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  38.64 
 
 
377 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 
390 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.93 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
437 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  37.81 
 
 
346 aa  97.4  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.08 
 
 
407 aa  97.1  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
414 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.57 
 
 
356 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
411 aa  96.3  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.18 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
421 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
386 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
689 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
403 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  35.63 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  33.52 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.18 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  34.43 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
395 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  34.43 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  22.18 
 
 
373 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.23 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  36.57 
 
 
373 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
413 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
409 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  34.48 
 
 
385 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
464 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  31.88 
 
 
402 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
422 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 
358 aa  93.6  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  36.64 
 
 
382 aa  93.2  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.72 
 
 
935 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.8 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
810 aa  93.2  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  36.23 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
402 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  26.36 
 
 
388 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
339 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
376 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
391 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
360 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  32.7 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.11 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  38.62 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  38.62 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  35.52 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  38.62 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  38.62 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>