More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0890 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  100 
 
 
420 aa  867    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  41.75 
 
 
419 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6301  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
414 aa  193  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  35.49 
 
 
391 aa  177  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
409 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
419 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
415 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
386 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
407 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
382 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  24.76 
 
 
437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3341  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
426 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178171  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1818  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
382 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0364  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 
412 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  33.07 
 
 
401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1382  glycosyltransferase-like protein  29.39 
 
 
387 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.702037  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2879  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
385 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.658622  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3374  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
408 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0766435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  37.65 
 
 
360 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2971  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
391 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.176769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
372 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
426 aa  99.8  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
409 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
426 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6548  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6549  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0868  a-glycosyltransferase  30.84 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0630159 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
820 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
396 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
419 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
370 aa  94.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
507 aa  93.2  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
373 aa  93.2  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
414 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
810 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
371 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
387 aa  89.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.01 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  28.37 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1916  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
383 aa  87  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
377 aa  87  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
381 aa  87  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
400 aa  87  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
398 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
827 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
816 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  26.21 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2150  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  39.23 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
394 aa  84  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  24.55 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
379 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  37.12 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  36.64 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
422 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.69 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
402 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
394 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>