More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0783 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
394 aa  777    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  37.86 
 
 
373 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  41.49 
 
 
904 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  42.63 
 
 
395 aa  249  9e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  41.51 
 
 
395 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 
378 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  38.14 
 
 
377 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
383 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
367 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
383 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 
366 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
359 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
369 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
381 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
409 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  29.88 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
360 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  38.57 
 
 
440 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
381 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
406 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
406 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  30.22 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.04 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
404 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
353 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
360 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.55 
 
 
406 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.23 
 
 
406 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.23 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.55 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
386 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
426 aa  111  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.23 
 
 
406 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 
377 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
810 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  37.26 
 
 
430 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
374 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
446 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  32.81 
 
 
406 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  32.81 
 
 
406 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
377 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  41.62 
 
 
770 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
411 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  36.1 
 
 
385 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  34.12 
 
 
405 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.23 
 
 
406 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
405 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 
384 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
411 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
420 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 
420 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 
376 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
417 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 
412 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
392 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
389 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
419 aa  106  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
406 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.38 
 
 
377 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 
507 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.33 
 
 
406 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
375 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  37.61 
 
 
408 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 
385 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  42.17 
 
 
370 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 
414 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  37.17 
 
 
374 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
383 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
382 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  32.65 
 
 
406 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
415 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
425 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
406 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.13 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
412 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
412 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
412 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
410 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  38.8 
 
 
384 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
414 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  37.38 
 
 
374 aa  103  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
413 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
402 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  34.72 
 
 
388 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 
439 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  30.24 
 
 
419 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
427 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
407 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
380 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  32.24 
 
 
406 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>