More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0017 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
366 aa  695    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  38.11 
 
 
373 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  43.09 
 
 
395 aa  237  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  40.26 
 
 
904 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  40.44 
 
 
395 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  38.38 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  39.08 
 
 
377 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
367 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
383 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
359 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  37.92 
 
 
409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
417 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  30.85 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 
426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  40.34 
 
 
398 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  37.17 
 
 
369 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  38.57 
 
 
408 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 
410 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  42.67 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  37.04 
 
 
411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  33.73 
 
 
406 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  33.33 
 
 
406 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  33.33 
 
 
406 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  34.24 
 
 
406 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
393 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  41.8 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  40.33 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.55 
 
 
406 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 
407 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  38.36 
 
 
403 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  34.28 
 
 
415 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
417 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
401 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.572056 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  32.55 
 
 
406 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  32.55 
 
 
406 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 
454 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
360 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 
366 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
422 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 
405 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  43.55 
 
 
413 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
406 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.78 
 
 
405 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
394 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 
401 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  32 
 
 
406 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  32 
 
 
406 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
420 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
420 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
422 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  38.96 
 
 
414 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  41.71 
 
 
382 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
401 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  39.88 
 
 
366 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 
409 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
406 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.98 
 
 
406 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  38.63 
 
 
351 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
407 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
382 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 
375 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 
377 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
417 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 
415 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  40.66 
 
 
399 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
770 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.98 
 
 
406 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 
433 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 
386 aa  99.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
385 aa  99.4  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  43.4 
 
 
739 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  38.13 
 
 
399 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  45.28 
 
 
370 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  41.99 
 
 
374 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  41.62 
 
 
440 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 
412 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  34.42 
 
 
452 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  42.78 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
410 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
377 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.74 
 
 
419 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  41.57 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  40.94 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 
374 aa  96.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
402 aa  96.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>