More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3107 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 426 aa  857    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  82.12 
 
 		 430 aa  689    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  56.96 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  44.56 
 
 		 415 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  42.01 
 
 		 410 aa  240  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  42.75 
 
 		 412 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 		 420 aa  235  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 		 420 aa  235  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 		 409 aa  226  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 454 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.85 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 		 416 aa  190  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  35.57 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 414 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  32.52 
 
 		 414 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.09 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  33.41 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 400 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  36.2 
 
 		 401 aa  173  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 		 409 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 417 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  34.29 
 
 		 408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  36.24 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 		 426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 415 aa  153  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.83 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  37.54 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.67 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  31.46 
 
 		 443 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.79 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.79 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.91 
 
 		 406 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  29.05 
 
 		 411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.08 
 
 		 406 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.76 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 403 aa  132  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  29.71 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  29.71 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  27.08 
 
 		 419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  30.15 
 
 		 654 aa  127  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 437 aa  126  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.81 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.35 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  30.51 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 415 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 904 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  42.77 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  36.05 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  23.54 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  32.1 
 
 		 392 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 		 414 aa  112  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 378 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  27.21 
 
 		 382 aa  109  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 		 360 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 1302 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  33.47 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>