More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4215 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
407 aa  822    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 
401 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
426 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
440 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  32.04 
 
 
403 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
415 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.68 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
411 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.5 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
409 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
452 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
416 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
417 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
410 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
426 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
410 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  34.95 
 
 
406 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  34.95 
 
 
406 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
417 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  34.95 
 
 
406 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
415 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  34.95 
 
 
406 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  34.47 
 
 
406 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
425 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  42.41 
 
 
396 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  36.84 
 
 
406 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  36.84 
 
 
406 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
417 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
400 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  26.54 
 
 
452 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
405 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 
377 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.98 
 
 
408 aa  99.8  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.59 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
427 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  36.36 
 
 
406 aa  97.1  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 
390 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  36.02 
 
 
406 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  36.02 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
419 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
413 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.28 
 
 
400 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  35.07 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
415 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
373 aa  93.6  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  28.62 
 
 
414 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
406 aa  93.2  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
373 aa  92.8  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  26.63 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  32.43 
 
 
443 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
377 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
394 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
407 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
411 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
360 aa  87.4  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
405 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  31.88 
 
 
419 aa  84  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
396 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2376  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 
418 aa  82.8  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.54 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24.53 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  25.72 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
364 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>