More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4597 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 415 aa  835    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  70.77 
 
 		 415 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  68.36 
 
 		 415 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  63.39 
 
 		 411 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  53.07 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  52.1 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  51.86 
 
 		 405 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  50.5 
 
 		 414 aa  362  6e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  40.29 
 
 		 416 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 		 410 aa  261  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  38.31 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  38.31 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  36.28 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 409 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  34.42 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 422 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  33.5 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 		 417 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 		 417 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.57 
 
 		 426 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  34.97 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.11 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 403 aa  133  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.47 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  29.44 
 
 		 403 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.12 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.34 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.05 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.88 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.12 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.07 
 
 		 405 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 400 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.4 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 1302 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  37.28 
 
 		 419 aa  103  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 		 415 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  29.01 
 
 		 408 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  25.06 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  25.06 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  26.82 
 
 		 654 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 		 437 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 371 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 409 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  37.1 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  34.48 
 
 		 638 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 384 aa  93.6  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 364 aa  94  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 		 377 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  25.2 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 		 364 aa  93.2  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  24.47 
 
 		 406 aa  92.8  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  24.23 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  35.15 
 
 		 366 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>