More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7223 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
413 aa  794    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  84.22 
 
 
405 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  66.5 
 
 
426 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  53.43 
 
 
411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  54.13 
 
 
415 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  52.91 
 
 
415 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  53.07 
 
 
415 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  51.47 
 
 
414 aa  355  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  39.53 
 
 
416 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
410 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 
420 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
420 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 
417 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
422 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  37.09 
 
 
443 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 
454 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  36.66 
 
 
452 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 
417 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  38.42 
 
 
425 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
409 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  33.49 
 
 
414 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  31.59 
 
 
430 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 
410 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
426 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  33.41 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.37 
 
 
409 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 
440 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
403 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 
410 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  40.24 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
452 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
401 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
411 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
401 aa  109  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
406 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
417 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
407 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.3 
 
 
407 aa  106  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
410 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  28.71 
 
 
403 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  37.55 
 
 
409 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  33.33 
 
 
419 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  41.75 
 
 
366 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  31.29 
 
 
654 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  40.89 
 
 
395 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.93 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
400 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
404 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  39.44 
 
 
395 aa  93.2  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.64 
 
 
406 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.21 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  36.24 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.41 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  35.41 
 
 
386 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
359 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.41 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
400 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
411 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  24.64 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
904 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  35.59 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  29.16 
 
 
408 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  24.64 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
373 aa  90.1  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
405 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.17 
 
 
406 aa  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  38.66 
 
 
377 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.54 
 
 
419 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 
405 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  23.99 
 
 
406 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  42.77 
 
 
398 aa  87  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
437 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
406 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
374 aa  86.3  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  39.27 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
407 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  25.12 
 
 
406 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  24.47 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  35.02 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  39.02 
 
 
419 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  29.55 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>