More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1993 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 414 aa  840    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  49 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  46.44 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  46.19 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  42.46 
 
 		 452 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  42.44 
 
 		 425 aa  258  9e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  36.12 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  36.12 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 		 454 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  34.05 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 		 430 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  36.52 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  29.9 
 
 		 403 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  30.58 
 
 		 411 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  31.26 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.26 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  30.44 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.51 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 417 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 413 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.68 
 
 		 409 aa  143  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 406 aa  142  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.4 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  28.61 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  28.61 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.09 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.95 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.09 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.36 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.64 
 
 		 406 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.61 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.61 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.72 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.37 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.9 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 904 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 1302 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 412 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 		 386 aa  100  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 473 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  27.22 
 
 		 404 aa  90.5  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  23.37 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 		 398 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 419 aa  88.2  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>