More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2655 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
395 aa  784    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  48.81 
 
 
904 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  41.05 
 
 
373 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  42.63 
 
 
394 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  39.27 
 
 
395 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  41.01 
 
 
377 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  40.81 
 
 
378 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  38.42 
 
 
367 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
359 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 
381 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  44.76 
 
 
366 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 
360 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
417 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
369 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  37.54 
 
 
426 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  30.79 
 
 
391 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
416 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  37.76 
 
 
430 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
410 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 
409 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
440 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
770 aa  121  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
420 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 
420 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 
425 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
377 aa  120  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  44.25 
 
 
377 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  39.6 
 
 
376 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  41.9 
 
 
410 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
414 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
401 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.79 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 
376 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
383 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  28.52 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  41.71 
 
 
374 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
374 aa  113  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  39.15 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  34.56 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.25 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.25 
 
 
406 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.86 
 
 
398 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
410 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  30.56 
 
 
406 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.9 
 
 
406 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  30.56 
 
 
406 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
439 aa  110  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  37.61 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
422 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  37.77 
 
 
409 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.93 
 
 
409 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
414 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
423 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
409 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.56 
 
 
406 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
387 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.56 
 
 
406 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
387 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
417 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  38.05 
 
 
388 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
409 aa  106  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.16 
 
 
407 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  31.76 
 
 
414 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
410 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 
407 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.4 
 
 
406 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  39.41 
 
 
384 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  36.86 
 
 
377 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
452 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 
373 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  39.8 
 
 
375 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  39.8 
 
 
375 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  39.8 
 
 
375 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
373 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.4 
 
 
406 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
387 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
356 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
403 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
406 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
393 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
390 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
391 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 
385 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  38.16 
 
 
411 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>