More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1643 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
359 aa  735    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
904 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.83 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  36.73 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
394 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  36.28 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  36.28 
 
 
406 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  36.28 
 
 
406 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
381 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
385 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  35.84 
 
 
406 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
378 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  35.56 
 
 
406 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  35.56 
 
 
406 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
420 aa  136  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 
420 aa  136  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 
406 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  28.66 
 
 
419 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  37.17 
 
 
406 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  37.17 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  37.17 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  36 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  37.17 
 
 
406 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  37.17 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  41.24 
 
 
416 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
366 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
422 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  36.93 
 
 
454 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
422 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
399 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  30.53 
 
 
414 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
417 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
410 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.28 
 
 
391 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
417 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
417 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
415 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
383 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
410 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
407 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
412 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
377 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.01 
 
 
378 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
377 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
403 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
409 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
401 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
440 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
404 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
398 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
417 aa  96.3  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
384 aa  95.9  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
425 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
411 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 
413 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  32.86 
 
 
443 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  30.39 
 
 
452 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  29.9 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
405 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
415 aa  93.6  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.85 
 
 
407 aa  93.2  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
409 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
410 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  38.18 
 
 
364 aa  92.8  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
401 aa  92.8  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.29 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
409 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  33.15 
 
 
403 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
452 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
415 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
369 aa  90.1  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
376 aa  90.5  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
415 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
395 aa  90.1  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
414 aa  89.4  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
409 aa  89.4  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
660 aa  89.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  28.62 
 
 
411 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
414 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
377 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
406 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>