More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02000 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  100 
 
 		 452 aa  889    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  42.65 
 
 		 422 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  42.65 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  42.51 
 
 		 417 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  43.14 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  46.55 
 
 		 425 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  34.8 
 
 		 420 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 		 420 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  36.01 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  37.53 
 
 		 454 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  39.09 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 		 410 aa  171  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.95 
 
 		 409 aa  170  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  32.94 
 
 		 443 aa  163  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 		 410 aa  163  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  34.06 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  39.7 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 414 aa  161  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  38.93 
 
 		 405 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 415 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 		 415 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 417 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 411 aa  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.57 
 
 		 406 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 414 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.65 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 411 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 407 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.64 
 
 		 400 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 409 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 		 405 aa  136  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  30.81 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.6 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 		 407 aa  127  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.88 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.83 
 
 		 406 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.85 
 
 		 406 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.83 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 373 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.6 
 
 		 406 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  40.7 
 
 		 367 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  26.37 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  26.37 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.01 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.25 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.01 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 		 427 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 904 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.73 
 
 		 770 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  25.78 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  38.95 
 
 		 350 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 1302 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  37.02 
 
 		 409 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 386 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  23.58 
 
 		 346 aa  97.8  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 392 aa  97.8  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 		 395 aa  96.7  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  48.2 
 
 		 389 aa  96.7  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 378 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 386 aa  96.3  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  26.91 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  26.84 
 
 		 654 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 		 408 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>