More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2058 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
452 aa  924    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  46.65 
 
 
410 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  39.2 
 
 
473 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
420 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
420 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
410 aa  186  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
454 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  33.41 
 
 
440 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
416 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
409 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  33.17 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
422 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
422 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
417 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
406 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 
410 aa  156  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  31.76 
 
 
654 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
425 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
417 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 
430 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  31.79 
 
 
403 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
426 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.95 
 
 
414 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
401 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
414 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  31.49 
 
 
443 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
411 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
415 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  28.57 
 
 
411 aa  134  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
409 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.99 
 
 
407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.19 
 
 
409 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
414 aa  123  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
410 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
415 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.27 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  38.02 
 
 
367 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
405 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
413 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
415 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 
404 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
401 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.53 
 
 
406 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.09 
 
 
400 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.86 
 
 
406 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 
395 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.46 
 
 
406 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
395 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.53 
 
 
406 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
400 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
360 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
904 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
419 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.68 
 
 
408 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  31.98 
 
 
346 aa  99.8  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
400 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.05 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.01 
 
 
405 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
411 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
407 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
366 aa  96.7  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
409 aa  96.7  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  24.38 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  24.38 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
377 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  23.97 
 
 
406 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
373 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32.82 
 
 
401 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
364 aa  94  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 
382 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  23.42 
 
 
406 aa  93.2  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
378 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
404 aa  92.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  24.48 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
394 aa  92  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
386 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
406 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  24.73 
 
 
406 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
407 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  37.75 
 
 
396 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  23.63 
 
 
406 aa  89  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
384 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
364 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
386 aa  87.8  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
412 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>