More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5113 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
382 aa  775    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
409 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
412 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
406 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2615  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
395 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5063  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
390 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 
452 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
396 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  35.33 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  39.25 
 
 
394 aa  90.9  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3261  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  56.25 
 
 
388 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  40.8 
 
 
410 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  43.27 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  40.69 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 
396 aa  82  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  36.36 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  40.91 
 
 
389 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  37.18 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  26.07 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  39.2 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  42.06 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  39.86 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
403 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.35 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  45.19 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  36.99 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  40.37 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  39.72 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  38.98 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  32.72 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4362  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  41.12 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  31.08 
 
 
358 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  44.34 
 
 
358 aa  77  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.66 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  38 
 
 
439 aa  75.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  40.56 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.26 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  42.64 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  40.38 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  40.38 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.76 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  34.29 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  40.65 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1616  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  38.3 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  38.3 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  44.23 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  39.8 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  38.06 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  42.98 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  29.44 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  40.57 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  29.94 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3299  glycosyl transferase group 1  36.44 
 
 
362 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1496  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5069  glycosyl transferase group 1  40.85 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  29.07 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.55 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>