More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3689 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 414 aa  833    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  54.72 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  50 
 
 		 411 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  50.5 
 
 		 415 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  47.95 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  52.49 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  51.35 
 
 		 413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  47.47 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  40.28 
 
 		 416 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 		 410 aa  229  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  39.06 
 
 		 443 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  36.19 
 
 		 454 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  34.72 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  35.29 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 		 425 aa  156  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 410 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  34.49 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.71 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 401 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 407 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 411 aa  106  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  32.75 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.61 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.85 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.78 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.54 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.54 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.85 
 
 		 409 aa  97.1  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 409 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 400 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 		 359 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 1302 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  28.12 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  25.31 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  28.12 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.75 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.1 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.64 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.61 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.13 
 
 		 406 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 		 409 aa  89.7  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.23 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 396 aa  87  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  39.77 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  27.58 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.77 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  39.84 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 904 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 455 aa  79.7  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>