More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1851 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
406 aa  842    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  70.43 
 
 
406 aa  588  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  68.66 
 
 
411 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.75 
 
 
407 aa  548  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.78 
 
 
409 aa  317  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 
409 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  39.74 
 
 
414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.18 
 
 
400 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
400 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 
411 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
407 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
407 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  34.22 
 
 
405 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  34.22 
 
 
405 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  38.78 
 
 
408 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
440 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  35.18 
 
 
404 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
430 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
401 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
415 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
426 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
417 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
410 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
422 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
422 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
412 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
454 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
400 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
410 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  32.84 
 
 
403 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
416 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
409 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
410 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
437 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  29.82 
 
 
452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.3 
 
 
414 aa  127  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
426 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  30.1 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
350 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
373 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  26.2 
 
 
406 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  26.2 
 
 
406 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  38.58 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
415 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
425 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  38.42 
 
 
367 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.12 
 
 
406 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  26.78 
 
 
411 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.6 
 
 
406 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.6 
 
 
406 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
406 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.78 
 
 
406 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.84 
 
 
406 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
398 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  27.6 
 
 
350 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
396 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
406 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
374 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
410 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.78 
 
 
406 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 
413 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 
398 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.54 
 
 
406 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.6 
 
 
406 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
367 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.37 
 
 
406 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
412 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
473 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
394 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.16 
 
 
381 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
426 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
409 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  39.88 
 
 
383 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
414 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
371 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
398 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
355 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
404 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  40.35 
 
 
412 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
379 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
373 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 
381 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
394 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  40.41 
 
 
396 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  35.67 
 
 
363 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  42.11 
 
 
374 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>