More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3085 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
409 aa  834    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
420 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 
420 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 
416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  35.99 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
410 aa  192  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
417 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  37.27 
 
 
454 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
415 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
440 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
415 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  34.79 
 
 
413 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  35.29 
 
 
443 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
410 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
412 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
452 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  34.54 
 
 
405 aa  176  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  33.42 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  31.25 
 
 
411 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
414 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
422 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
422 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  31.84 
 
 
452 aa  162  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
403 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
415 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
426 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
425 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  31.33 
 
 
403 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.5 
 
 
407 aa  155  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
417 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
417 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  34.37 
 
 
401 aa  151  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
405 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.92 
 
 
405 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
406 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
417 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
407 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.56 
 
 
409 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
411 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
401 aa  144  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
473 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
400 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
395 aa  122  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.76 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.75 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
407 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  26.75 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 
367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  26.75 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
396 aa  119  7e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.25 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.5 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 
373 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.25 
 
 
406 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
427 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
406 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
410 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
414 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
409 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  29.29 
 
 
408 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 
377 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  43.94 
 
 
366 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
364 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
406 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
360 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.5 
 
 
406 aa  106  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
395 aa  106  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  38.61 
 
 
638 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
406 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
382 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.03 
 
 
381 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  30.03 
 
 
381 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  30.03 
 
 
381 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  30.03 
 
 
381 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.03 
 
 
381 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.39 
 
 
406 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  25.41 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
381 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
433 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
378 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  32.11 
 
 
419 aa  102  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.25 
 
 
406 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.03 
 
 
381 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.72 
 
 
381 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
904 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
359 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
381 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
393 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
377 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>