More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3362 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 433 aa  857    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  35.46 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 453 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  31.52 
 
 		 935 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  28.94 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.85 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.45 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.02 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  31.17 
 
 		 428 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  40.8 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 419 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.15 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 371 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.76 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 425 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 		 443 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 		 443 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.38 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  20.46 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 		 499 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 		 398 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 		 498 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 		 495 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  40.53 
 
 		 387 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 		 364 aa  103  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 366 aa  103  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.29 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.34 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.27 
 
 		 431 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 768 aa  100  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 384 aa  100  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 409 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 		 420 aa  99.8  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 423 aa  99.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 376 aa  99.8  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 448 aa  99.8  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 455 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 364 aa  99  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  20.97 
 
 		 536 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.64 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  29.03 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 438 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 438 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>