More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3987 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
376 aa  749    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.26 
 
 
377 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  50.67 
 
 
388 aa  358  7e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  48.24 
 
 
371 aa  341  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  47.47 
 
 
382 aa  334  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  43.73 
 
 
377 aa  332  4e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.34 
 
 
377 aa  332  9e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.94 
 
 
380 aa  330  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  47.17 
 
 
387 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  43.94 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  44.27 
 
 
379 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.68 
 
 
341 aa  290  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  41.11 
 
 
396 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  40.53 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  39.78 
 
 
404 aa  249  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  43.16 
 
 
374 aa  246  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  38.62 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  38.03 
 
 
385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  54.67 
 
 
339 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.89 
 
 
385 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.89 
 
 
385 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.89 
 
 
378 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.89 
 
 
385 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.89 
 
 
378 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.89 
 
 
385 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.89 
 
 
385 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  44.63 
 
 
378 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.61 
 
 
378 aa  222  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  39.14 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  43.46 
 
 
378 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  39.14 
 
 
378 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  39.14 
 
 
378 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  39.14 
 
 
378 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 
382 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  39.41 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  37.81 
 
 
371 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  43.23 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  40.05 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  39.11 
 
 
372 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  40.12 
 
 
382 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  41.46 
 
 
390 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  40.19 
 
 
408 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
379 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  40.18 
 
 
373 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  37.42 
 
 
381 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
383 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  41.39 
 
 
384 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
374 aa  192  7e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.8 
 
 
377 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  40.2 
 
 
371 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  37.81 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  27.35 
 
 
377 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  39.43 
 
 
387 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
373 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  27.08 
 
 
377 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
375 aa  187  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  37.13 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
369 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
381 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
381 aa  178  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  39.88 
 
 
598 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  29.76 
 
 
371 aa  171  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
396 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  31.78 
 
 
371 aa  167  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
382 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  28.03 
 
 
378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
390 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  40.21 
 
 
379 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  37.27 
 
 
379 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  27.94 
 
 
376 aa  152  8e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  27.42 
 
 
376 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  27.15 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  25.84 
 
 
375 aa  147  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
375 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  28 
 
 
370 aa  146  5e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  27.89 
 
 
376 aa  146  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
362 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
387 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
378 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  35.29 
 
 
148 aa  107  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
403 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  27.1 
 
 
383 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  31.92 
 
 
381 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
387 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
379 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
387 aa  99.8  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
377 aa  99.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
362 aa  99.8  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  28.19 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
413 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>