More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2250 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  100 
 
 
384 aa  777    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  77.55 
 
 
384 aa  597  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  51.52 
 
 
363 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  53.59 
 
 
363 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  48.48 
 
 
373 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.6 
 
 
360 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  26.3 
 
 
350 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.01 
 
 
365 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
380 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
353 aa  111  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  31.74 
 
 
406 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
371 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
394 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
387 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  31.27 
 
 
404 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
672 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
378 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
382 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
368 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
375 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
415 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1156  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
405 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.656531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  31.22 
 
 
935 aa  96.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
424 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
372 aa  96.3  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
419 aa  96.3  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  37.37 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
800 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
353 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
438 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
392 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.81 
 
 
443 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.81 
 
 
443 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.81 
 
 
499 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.81 
 
 
443 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.81 
 
 
443 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.81 
 
 
498 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.81 
 
 
495 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
413 aa  93.6  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
360 aa  93.2  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2978  glycosyltransferase-like protein  27.34 
 
 
357 aa  92.8  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
394 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.45 
 
 
396 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
536 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.6 
 
 
405 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  28.4 
 
 
404 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  32.48 
 
 
340 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
375 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
385 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
346 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
433 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
438 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0312  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 
389 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
438 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
419 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  24.69 
 
 
403 aa  89.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
396 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.8 
 
 
404 aa  89.7  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
390 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
409 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  23.85 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 
413 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.77 
 
 
392 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  38.1 
 
 
395 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
374 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
437 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
748 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
437 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
377 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 
381 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
408 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.87 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.97 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  31.18 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
439 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
439 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>