More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0312 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0312  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
389 aa  781    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
398 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  31.25 
 
 
370 aa  91.3  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  37.3 
 
 
384 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
386 aa  87  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 
419 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
350 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  30.77 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  30.7 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  33.61 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  37.16 
 
 
638 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.18 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.53 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  26.83 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  31.45 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  25.13 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  28.04 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  37.21 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  34.62 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  23.78 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  39.5 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3690  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1496  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3299  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
453 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
750 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2475  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.770034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  30.91 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  37.07 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  37.88 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  33.33 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  34.21 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
406 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
429 aa  67  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
353 aa  67  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3396  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
395 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.08 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>