More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6235 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
381 aa  772    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  77.17 
 
 
380 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  60.51 
 
 
371 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.75 
 
 
360 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
389 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  35.34 
 
 
365 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 
368 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
358 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
373 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  25.14 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  30.65 
 
 
384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
391 aa  132  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  31.63 
 
 
363 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
351 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
374 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
366 aa  97.4  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
739 aa  96.3  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0730  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00119132  hitchhiker  0.00102221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
383 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
396 aa  93.6  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  30.16 
 
 
382 aa  92.8  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
379 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  40.54 
 
 
453 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
386 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
371 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
378 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
401 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
376 aa  90.1  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
398 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
391 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  30.51 
 
 
452 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2745  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
415 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.19 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
374 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
372 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
350 aa  86.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
672 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
408 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
412 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
391 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
378 aa  86.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
377 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.71 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07315  glycosyltransferase  25.86 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.160223  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  28.78 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.37 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.44 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
382 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  36.24 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
360 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.2 
 
 
462 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.2 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  30.11 
 
 
340 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0790  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.18 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  30.18 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>