More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1252 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 340 aa  697    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  54.6 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  33.43 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  35.59 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0264  phosphatidylserine decarboxylase  35.71 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 377 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 821 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 		 828 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.27 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 424 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 364 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 819 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 		 822 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.43 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 		 821 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  34.24 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  36.78 
 
 		 468 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.24 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  36.65 
 
 		 739 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 		 821 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 		 821 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 		 821 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.25 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 439 aa  97.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 414 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  32.76 
 
 		 369 aa  96.3  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.8 
 
 		 465 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.18 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 364 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 379 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 453 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.48 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.59 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  37.13 
 
 		 388 aa  93.2  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 419 aa  92.8  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 417 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  32.48 
 
 		 384 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.96 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  30 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  30 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.65 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.65 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.65 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  30 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  30.98 
 
 		 820 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  38.51 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.65 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  25.31 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 		 415 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 		 364 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.05 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 403 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 672 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.26 
 
 		 367 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.11 
 
 		 407 aa  90.1  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 386 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 386 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 361 aa  89.7  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 389 aa  89.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>