More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0389 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 359 aa  738    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  52.5 
 
 		 363 aa  391  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  54.18 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  52.12 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  48.86 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  46.72 
 
 		 361 aa  316  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  45.85 
 
 		 350 aa  301  9e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  42.94 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 364 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 364 aa  135  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 386 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.9 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.79 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  28.71 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  29.09 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  30.67 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  30.22 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  31.67 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 367 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  33.33 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  30.67 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 		 394 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.57 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 		 398 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 387 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 		 396 aa  96.3  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 739 aa  96.3  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 368 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  30.67 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.6 
 
 		 745 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  27.68 
 
 		 370 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 		 370 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.51 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 398 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 381 aa  92.8  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 374 aa  92.8  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  25 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.15 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.86 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  31.43 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.59 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 419 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  31.92 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  29.31 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 350 aa  91.3  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.59 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  29.59 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  29.59 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  29.59 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.59 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.59 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 750 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 380 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 378 aa  90.1  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 380 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.59 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>