More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2032 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
355 aa  723    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  47.99 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3017  glycosyl transferase group 1  45.82 
 
 
360 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3299  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
364 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
364 aa  139  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
364 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
364 aa  125  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
360 aa  119  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
360 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  25.84 
 
 
363 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  23.71 
 
 
346 aa  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
359 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
350 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
409 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  25.56 
 
 
357 aa  90.5  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
382 aa  89.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
389 aa  85.9  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  30.54 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
361 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  27.25 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
398 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  26.57 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
378 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
418 aa  79.3  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  35.53 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
384 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.11 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.71 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
403 aa  77  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
401 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  29.7 
 
 
366 aa  77  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.7 
 
 
366 aa  77  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1097  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.372916  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
413 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  31.58 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3093  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  23.39 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.07 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.56 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  32.07 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  24.45 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
1080 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1432  glycosyltransferase  29.17 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
1079 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  33.87 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
739 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  44.09 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  31.82 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.08 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  32.21 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0440  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.438778  normal  0.0102055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>